为了推进卫生系统内部审计规范化建设，建立健全卫生系统内部审计制度，规范卫生系统内部审计的内容、程序与方法，更有效地发挥内部审计为医疗卫生机构增加价值和改善运营的目标，在中国内部审计协会的大力支持下，卫生部规划财务司组织编写了《卫生系统内部审计操作指南》（以下简称“指南”）。该书已经正式由人民卫生出版社出版发行。该指南由卫生部副部长陈啸宏同志作序、规划财务司主编，委托南京审计学院作为课题研究，由卫生系统内部审计专业人员共同参编完成。

该指南既有多年实际工作的经验总结，又有深入的理论研究，具有很强的理论性、系统性、实用性和可读性。全书共分总则、财务收支审计、内部控制审计、预决算审计、经济责任审计、建设工程项目审计、经济合同审计、计算机辅助审计和审计档案管理等9个章节，附录收入了一些常用法律法规和我部印发的相关文件。该书对进一步推进卫生系统内部审计工作标准化、程序化、规范化建设具有很强的指导作用，对促进内部审计人员素质和审计水平的整体提高具有积极意义。